软件介绍
分子克隆是生物科研学者必不可少的一项实验技能,在实验设计中我们也避免不了使用一些分子生物学的软件,例如DNAStar、DNAman、Vector NTI……
那么今天给大家推荐一款非常nice的质粒图谱的设计软件—SnapGene!
SnapGene特点:
轻松计划和模拟DNA操作;
可视化的ORF阅读框,和引物结合位点;
自动记录在克隆项目的步骤;
可与其他研究人员共享注明的序列文件。
用它做质粒图谱、查找酶切位点、标记基因片段属性、查看引物所在位置,查看开放阅读框所编码氨基酸、及序列比对。SnapGene无疑就是做分子克隆的利器。
简易界面
基本功能介绍


SnapGene独特的限制克隆界面以干净的布局显示您需要的信息。如果你已经知道你想要做什么,克隆模拟只需要几秒钟。如果克隆程序存在设计缺陷,则可以在模拟过程中捕获并纠正错误。
3.PCR&诱变
PCR模拟界面
设计引物后,可用它们来模拟常规PCR,重叠延伸PCR或诱变。产生的DNA序列文件立即可用于进一步操作。与限制性克隆界面一样,针对引物的界面以直观的方式显示关键信息。
PCR生成产物
4.自动文档

琼脂糖凝胶模拟图
琼脂糖凝胶电泳SnapGene使用先进的算法来创建逼真的琼脂糖凝胶模拟。限制片段以三种格式显示:模拟凝胶,数字列表和序列图。您可以使用模拟凝胶计划诊断性限制消化,或将实际凝胶图像与预测模式进行比较。
6.使用SnapGene,DNA序列注释非常简单
序列特征图
SnapGene格式与GenBank标准相匹配,但添加了诸如颜色,方向性和片段等选项。编码序列被翻译,以便您可以可视化密码子,追踪氨基酸编号,并检查阅读框架以寻找基因融合。功能可以从其他文件导入,或者从可定制列表中自动注释。
7.SnapGene为引物设计和可视化提供了革命性工具
引物设计图
SnapGene使用严格的热力学算法来计算解链温度和双链路线。您可以使用引物模拟程序,如PCR,诱变和In-Fusion克隆。引物可以从其他文件导入或导出为文本格式。
8.多功能数据导入和导出
SnapGene可以读取许多常见的文件格式,捕获DNA序列和注释。支持的格式列表包括APE、DNASTAR的Lasergene、基因工程Kit、基因库、MacVector、矢量NTI等等。
寄语
SnapGene既可以方便的分析酶切位点、标签、启动子、终止子和复制子元件,并能知道其具体序列,还可以生成详细的DNA序列文件,与同事共享。可视化显示效果和操作效果,极易上手,这是一款不可多得的分子生物学软件,喜欢的研友们就种草吧。